修剪對牡丹催花苗至關重要，可以說是成功的關鍵，直接關系到棵形的好壞、成花枝數的多少和花朵是否碩大純正。
平茬牡丹的枝條生長有頂端優(yōu)勢，為保證催花苗的枝條數，必須平茬，促進枝條的萌發(fā)。第一年秋季牡丹定植后，應立即平茬，一般修剪高度與地面水平。第二年、第三年秋季(10月中旬)繼續(xù)平茬，對萌發(fā)力強的品種可按地平修剪，萌發(fā)力弱的可在高于地平2-3厘米處平茬，以保證有更多的芽點萌發(fā)。連續(xù)平茬主要是促進地下部的快速生長，貯存養(yǎng)分，形成整齊而多的枝條，以便第四年進行催花。
正常修剪因為前三年秋季都要平茬，所以催花苗的正常修剪主要在第四年早春和初夏進行。修剪的內容有：①定股和疏枝。定股和疏枝是為了決定主要枝條數目和保證催花苗的形狀。一般牡丹種植4年后，對生長勢強、成枝率高的品種可保留8-10個枝條；對生長勢弱、成枝率低的品種可保留5-7個枝條，剪去徒長枝、弱枝、重疊枝及病蟲害枝。②抹芽和除萌。抹芽主要是抹去每個枝條上除花芽以外的不定芽和腋芽，每個枝條留1個(最多2個)花芽，其他全部抹去。當二座花芽比頂芽還飽滿時，要抹去頂芽以保二座花芽;除 萌主要是剔除牡丹根際 處萌發(fā)的大量土芽、腳芽，以保證成花枝的營養(yǎng)供給。③牡丹下葉。牡丹催花苗下葉應比正常牡丹早些，10月上旬左右就應修剪下葉，以免消耗更多的養(yǎng)分，影響催花。