gst融合蛋白純化篇
1.如何純化gst融合蛋白?
2.可純化蛋白種類(lèi)
3.磁珠掛不上目的蛋白
以下的處理方案的前提是樣本里面有目的蛋白,如果是包涵體需要變性。
可能一:結(jié)合條件不對(duì)
理想的結(jié)合條件為ph 6.5-8.0,純化之前確認(rèn)磁珠是否采用緩沖液平衡以及蛋白樣本的ph值,低于ph6.5或高于ph8時(shí),融合蛋白與磁珠結(jié)合不充分導(dǎo)致結(jié)合效率低。
可能二:樣本中目的蛋白的濃度偏低
目的蛋白的濃度過(guò)低,會(huì)嚴(yán)重影響磁珠與蛋白的結(jié)合。
兩種方法可供選擇:
a)濃縮蛋白樣本;b)增加磁珠的濃度
可能三:檢查目的蛋白是否聚集沉淀
在細(xì)胞裂解前加入dtt,在緩沖液中也加入dtt 。1-20mm的dtt 會(huì)顯著增加某些gst融合蛋白的結(jié)合。
可能四:判斷是否是因?yàn)間st失活
過(guò)度超聲會(huì)破壞標(biāo)簽蛋白而減少其與磁珠的結(jié)合。減少超聲破碎的時(shí)間和強(qiáng)度。
可能五:標(biāo)簽蛋白可能改變了gst 構(gòu)相
降低結(jié)合的溫度來(lái)改善結(jié)果。
4.目的蛋白在磁珠上,洗脫不下來(lái)
*步:判斷是否結(jié)合
取mag beads加loading buffe煮沸,再跑page電泳。
如果確認(rèn)有蛋白,且載量還很高,那么極有可能是形成了過(guò)蛋白沉積。
太多的蛋白沉積在磁珠孔內(nèi),無(wú)法洗脫。建議將目的蛋白樣本稀釋?zhuān)倭考兓?br>第二步:調(diào)節(jié)洗脫條件
洗脫緩沖液ph,酸性的都洗不下蛋白。盡量將洗脫液的ph值調(diào)到8.0。
5.洗脫樣本里面有雜蛋白
可能一:非特異性吸附
提高平衡緩沖液中的鹽濃度可以降低因?yàn)殡x子作用帶來(lái)的非特異吸附。
在平衡緩沖液中添加0.5%吐溫或triton可以避免因?yàn)槭杷嗷プ饔脤?dǎo)致非特異吸附,這些措施都可以電泳的雜帶明顯減少。
可能二:26kd的gst條帶
gst融合蛋白的表達(dá)系統(tǒng)很容易表達(dá)到gst部分就終止,所以26kd左右的雜帶是很常見(jiàn)的,那可以選擇用不同濃度的還原*去做階段洗脫,如果還是分不開(kāi),那也許就得選擇離子交換或者凝膠過(guò)濾等別的分離手段。
可能三:蛋白降解
如果用上述方法還是雜帶多,那就地回頭去看看破碎的條件是不是太劇烈或者溫度控制不好導(dǎo)致蛋白短裂或者分解導(dǎo)致一些蛋白片段帶標(biāo)簽,或者因?yàn)闃悠烽L(zhǎng)時(shí)間保存導(dǎo)致水解等
可能四:蛋白相互作用
蛋白相互作用形成聚合體,導(dǎo)致雜帶增加,而由于疏水相互作用或者因?yàn)殡x子作用可以通過(guò)添加表面活性劑或者增加離子強(qiáng)度得到改善,對(duì)于因?yàn)樾纬删酆象w的可以在緩沖液和樣品中加1-2mm巰基乙醇避免。