參考文獻：
低深度測序在檢測單細胞染色體微小變異中的應(yīng)用探索
陳大洋1 甄賀富2 劉萍2 邱詠2 謝林2 劉弘泰1 陳芳2
（1. *大學(xué)華大教育中心，深圳 518083 ；2. 深圳華大基因研究院，深圳 518083）生物技術(shù)通報 biotechnology bulletin 2016, 32(12):58-64
生物技術(shù)通報影響力：雙核心期刊[（2017年中國科技核心期刊目錄）][中國科學(xué)引文數(shù)據(jù)庫來源期刊列表（2017—2018 年度）]
文章介紹測序目的：低深度測序在檢測單細胞 cnv方面的可行性。
單細胞測序?qū)ο螅航?jīng)過比較基因組雜交（array cgh，acgh）檢測的5例陽性細胞系
單細胞全基因組擴增方法：rubicon genomics 公司的 picoplex® wga kit和另一種商業(yè)試劑盒。
單細胞測序深度：數(shù)據(jù)量為 0.1 x
測序結(jié)果：rubicon 試劑盒具有較好的均勻性。
分析原因：rubicon 試劑盒先以原始基因組為模板進行復(fù)制，經(jīng)過 12 次循環(huán)后，再以擴增產(chǎn)物為模板進行擴增可有效降低擴增誤差，增加保真性。
原文摘要：旨在探討低深度測序在檢測單細胞染色體微小變異中的應(yīng)用。以經(jīng)過比較基因組雜交（array cgh，acgh）檢測的5例陽性細胞系為研究對象，從中分離的單細胞分別用兩種單細胞擴增試劑盒進行擴增，采用hiseq2000測序平臺進行全基因組測序，然后進行生物信息學(xué)分析，將檢測結(jié)果與已被 acgh 證實的結(jié)果進行比較。結(jié)果顯示，5 個單細胞的全基因組擴增成功，通過低深度測序均獲得明確的檢測結(jié)果。在用 genomeplex® single cell wga kit 試劑盒的處理中檢出區(qū)域與 acgh 檢測區(qū)域均有 80% 以上的重疊，1 個樣本檢出了 8 mb（megabase）左右的假陽性 ；在用 picoplex® wga kit 試劑盒處理時檢出信號與 acgh 區(qū)域也有 80%以上的重疊且無假陽性信號產(chǎn)生。證實在數(shù)據(jù)量為 0.1 x 左右時可以檢出單細胞染色體上 7 mb 以上的拷貝數(shù)變異。
picoplex® wga kit單細胞全基因組擴增試劑盒介紹picoplex wga kit被ivf行業(yè)供應(yīng)商如bluegnome信賴并用于胚胎植入前遺傳學(xué)篩查和診斷(pgs/pgd)。
英文名稱：rubicon picoplex wga kit
中文名稱：rubicon picoplex單細胞全基因組擴增試劑盒
品牌：rubicon genomics
貨號：r30050或rb3050（takara版）
用途：卵裂球和滋養(yǎng)外胚層細胞的植入前基因篩查（pgs）和需要單細胞擴增的循環(huán)腫瘤細胞（ctc）中的cnv檢測。
從單細胞中擴增dna構(gòu)建高重復(fù)性的文庫現(xiàn)在成為可能！picoplex wga kit采用技術(shù)，設(shè)計、優(yōu)化用于從單細胞中擴增單拷貝基因組dna。便捷的單管操作流程減少了手動操作的失誤，縮短了獲得結(jié)果的時間并降低背景。picoplex wga kit同樣也可用于6 pg至50 pg的純化gdna，并兼容微陣列比較基因組雜交（array cgh）分析及pcr。
picoplex技術(shù)概要
picoplex全基因組擴增技術(shù)具有高穩(wěn)定性和可再現(xiàn)性，已經(jīng)成為pgs的標準擴增技術(shù)。
技術(shù)要點：利用隨機引物引發(fā)線性擴增進行全基因組擴增。即先以原始基因組為模板進行復(fù)制，經(jīng)過多次循環(huán)后，再以擴增產(chǎn)物為模板進行擴增可有效降低擴增誤差，增加保真性。
名詞解釋：
拷貝數(shù)變異（copy number variations，cnvs）：cnv 是 指 與 參 照 基 因 組 比 較，1
kb-1 mb 的 dna 片段的缺失、插入、重復(fù)、倒位和復(fù)雜多位點的變異。
華雅旗下紅榮微再主營醫(yī)療核酸保存文庫擴增等產(chǎn)品，*代理(上海）rubicon genomics單細胞文庫擴增試劑。