產(chǎn)品名稱：rm 8375 測序性能評估的微生物基因組dna
英文名稱：microbial genomic dna standards for sequencing performance assessment(mg-001, mg-002, mg-003, mg-004)
品牌：nist
規(guī)格：4 vials, 1 each
運輸信息：干冰
rm 8375 微生物基因組dna在用于微生物全基因組測序的驗證、優(yōu)化、過程評估和性能評估。特別注意評估基因組序列。該材料旨在幫助評估高通量微生物 dna 測序方法的性能。該基因組 dna 已從細胞培養(yǎng)物中提取。因為 rm 是提取的 dna，所以它不評估 dna 提取等分析前步驟。然而，它確實對測序文庫制備、測序機器、堿基調用算法和隨后的生物信息學分析提出了挑戰(zhàn)。此 rm 并非旨在評估其他生物信息學步驟，例如菌株鑒定、系統(tǒng)發(fā)育分析或基因組注釋。基因組 dna 的純度被評估為適合這些目的。
rm 8375的一個單元由四個小瓶組成。每個小瓶包含不同的微生物基因組 dna 樣本（mg-001 鼠傷寒沙門.氏菌 lt2、mg-002 金黃色葡萄球.菌、mg-003 銅綠假單胞菌和 mg-004 產(chǎn)孢梭菌）。
儲存和使用說明
儲存：
rm 8375 微生物基因組dna 在 nist 的 –20 °c 溫度下儲存，但將與冷凍包裝一起運輸，并且可能不會冷凍到達。收到后，rm 8375 應在 –20 °c 的黑暗中長期儲存，或在 4 °c 的黑暗中短期儲存（如果使用時間可能在大約 8 周內）。
用途：
建議使用基因組序列來評估變異調用的準確性，而不是基因組組裝，因為正交測量方法對基因組序列結構存在分歧，并且無法解決差異。由于與用于評估堿基調用準確性的方法相關的復雜性以及基因組序列中的潛在錯誤，強烈建議用戶手動檢查具有高堿基調用錯誤率的推定區(qū)域周圍的對齊讀數(shù)。參考文獻 3 概述了評估微生物基因組中變異調用的最佳實踐。
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