前言:脂質(zhì)組學(xué)屬于新興研究領(lǐng)域,其核心工作是生物系統(tǒng)中各種脂類物質(zhì)的表征和定量分析。質(zhì) 譜法是否能夠成功檢測和鑒定出給定樣品中的數(shù)千種潛在脂質(zhì),將直接取決于脂質(zhì)液相色譜分離的策略。 肝臟、腦、心臟組織提取物是脂質(zhì)組學(xué)研究中常見的生物樣品。為證明色譜對脂質(zhì)組學(xué)分析 的影響,本應(yīng)用簡報以肝臟組織提取物為例,總結(jié)了使用反相 (rp) 和正相 (np) 色譜分離不 同類型脂質(zhì)的優(yōu)勢。 本研究工作采用agilent uhplc 1290液相色譜系統(tǒng)(包括二元泵、多孔板自動進(jìn)樣器和柱溫箱)進(jìn) 行。液相色譜通過安捷倫噴射流接口與 agilent 6540 q-tof 聯(lián)用。采用反相和正相色譜兩種 方法分離組織提取物。
• 肝臟總脂質(zhì)提取物購自 avanti polar lipids 公司(亞拉巴馬州阿拉巴斯 特),脂質(zhì)成分組成見上圖
• 將凍干的脂質(zhì)提取物復(fù)溶于 2:1 氯仿/ 甲醇溶液,然后用流動相 a 稀釋至 200 ng/µl
• 進(jìn)樣量 5 µl(含 1 µg 提取物),進(jìn) 行反相或
分析工作流程中數(shù)據(jù)分析的第一步是從結(jié)果 中提取分子特征,該特征由保留時間和質(zhì)量 數(shù)確定。此特征將化合物的所有特定加合物 和同位素的豐度濃縮為單個化合物的豐度。 分子特征提取由 agilent masshunter 定性 分析軟件(版本 b.07.00)通過 agilent 分 子特征提取器 (mfe) 算法進(jìn)行,脂質(zhì)標(biāo)注 通過 agilent metlin 脂質(zhì) pcdl (b.07) 和 simlipid 軟件(版本 4.20,premier biosoft 公司,加利福尼亞州帕羅奧圖)進(jìn) 行。metlin 脂質(zhì) pcdl 包含 640 張通過化學(xué)標(biāo)準(zhǔn)品獲得的 ms/ms 譜圖。simlipid 軟件支持脂質(zhì)譜圖的 ms/ms 理論匹配且包 含 36,224 個脂質(zhì)條目。
結(jié)果與討論 我們采用 mfe 算法對反相色譜法分離的肝 臟脂質(zhì)提取物進(jìn)行分析,得到了 4,108 種提 取化合物(特征)。然后我們在 metlin 數(shù)據(jù)庫中搜索化合物,得到 1,000 余種帶有 脂質(zhì)標(biāo)注的化合物,單次液質(zhì)聯(lián)用分析僅耗 時 38 分鐘(圖 1)。
與基于親脂性(主要由碳鏈長度和雙鍵數(shù)確 定)的反相色譜脂質(zhì)分離相比,正相色譜分 離主要基于脂質(zhì)頭基的極性。圖 3 表明正相 色譜對于偏極性的脂質(zhì)和帶電脂質(zhì)的分離非 常高效。但會流失中性脂質(zhì)(如甾醇類、二酰甘油類和三酰甘油類),因為使用這類 流動相時中性脂質(zhì)不能得到色譜保留。對于 能夠檢測到的化合物,用戶可根據(jù)已知的脂 質(zhì)分類特征搜索相應(yīng)的目標(biāo)數(shù)據(jù)庫,從而提 高脂質(zhì)標(biāo)注的準(zhǔn)確度。例如,我們可以將搜索范圍限制在 pe 脂質(zhì)中,具體方法有:在 限定的保留時間窗口中查詢洗脫化合物;僅 搜索 metlin 脂質(zhì) pcdl 中 pe 子集下的 pe 條目或進(jìn)行自定義的 simlipid 搜索。
表 1 所示為不同數(shù)據(jù)庫的搜索結(jié)果,數(shù)據(jù) 文件來自相同肝臟組織提取物在不同色譜法 和離子源條件下的分析。我們采用 mfe 算 法處理僅通過四極桿 1 獲取的數(shù)據(jù)文件。 所得化合物根據(jù) metlin 脂質(zhì) pcdl 標(biāo) 注,也可以使用 simlipid 軟件標(biāo)注。為 實現(xiàn)高準(zhǔn)確度的脂質(zhì)標(biāo)注,我們也對自動 ms/ms 數(shù)據(jù)文件進(jìn)行了 mfe 算法處理, 但只有含 ms/ms 數(shù)據(jù)的化合物才能用于數(shù) 據(jù)庫查詢??墒褂?metlin 脂質(zhì) pcdl 通 過譜庫匹配標(biāo)注化合物,也可以使用僅基于 ms/ms 數(shù)據(jù)的 simlipid 軟件進(jìn)行標(biāo)注。
重點注意:與 metlin pcdl(通過可靠 化學(xué)標(biāo)準(zhǔn)品獲得的高質(zhì)量專業(yè)譜庫)標(biāo)注不 同,simlipid 標(biāo)注是將 ms/ms 譜圖與理 論模擬生成的 ms/ms 碎片譜圖進(jìn)行匹配。 以上示例表明分析人員可對色譜法進(jìn)行優(yōu)化 以用于不同類型脂質(zhì)的分析,反相和正相液 質(zhì)聯(lián)用系統(tǒng)在脂質(zhì)組學(xué)分析中具有各自的選 擇性優(yōu)勢。反相液質(zhì)聯(lián)用系統(tǒng)的適用范圍更 加全面,能夠分離多種不同類型的脂質(zhì),實 現(xiàn)更多特征的檢測和標(biāo)注。另外,保留時 間具有很好的重現(xiàn)性,有助于色譜比對和差 異分析工作流程。正相液質(zhì)聯(lián)用系統(tǒng)的優(yōu)勢 在于能夠根據(jù)極性脂類的特征保留行為,對 其進(jìn)行更高準(zhǔn)確度的標(biāo)注。此外用戶還能夠 迅速通過色譜圖掌握樣品間脂質(zhì)種類的整體 差異。
結(jié)論:本文驗證了色譜法對復(fù)雜生物樣品中多種類 型脂質(zhì)進(jìn)行全面檢測和分析的能力。我們將 脂質(zhì)特異uhplc液相色譜方法與具有寬動態(tài)檢測范 圍的精確質(zhì)量 q-tof 聯(lián)用,并配合使用先 進(jìn)的特征查找軟件進(jìn)行自動化脂質(zhì)數(shù)據(jù)庫搜 索,實現(xiàn)了在單次液質(zhì)聯(lián)用分析中檢測和標(biāo) 注出 1,000 余種脂質(zhì)。分析人員可對色譜方 法開發(fā)進(jìn)行優(yōu)化,以靶向分析不同類型的脂 質(zhì),如我們使用兩種可選的液相色譜分離方 法 — 反相色譜和正相色譜對肝臟組織提取 物進(jìn)行的分離所示。從脂質(zhì)組學(xué)分析的角度 來看,這兩種方法具有各自的選擇性優(yōu)勢, 可使脂質(zhì)檢測覆蓋更加深入、全面。
關(guān)鍵詞:柱溫箱