pcr檢測試劑盒使用說明
1:樣品準(zhǔn)備:取1毫升細(xì)胞培養(yǎng)上清(貼壁和懸浮細(xì)胞都可以,已培養(yǎng)48小時以上),在16000g離心5分鐘,小心棄去上清,避免丟失沉淀(沉淀量有可能很少,目視看不到)。將沉淀用無菌pbs重懸,在16000g離心5分鐘,同樣小心棄去上清,如此反復(fù)用無菌pbs洗三次。后將獲得的沉淀用100微升超純水重懸,置于100℃水浴中孵育5分鐘。如此制備好的樣品可在4℃保存1到2個月。
2:pcr反應(yīng)的準(zhǔn)備:
待各組份融化后先瞬時離心,然后輕彈混勻。按下表在已滅菌的pcr管中配制反應(yīng)體系,每次實驗需加一個陰性和一個陽性對照,測試反應(yīng)管可以有多個。配制過程中應(yīng)注意無菌,并注意避免操作產(chǎn)生的氣溶膠造成樣品間的交叉污染,推薦在有風(fēng)壓的設(shè)備如超凈臺或生物安全柜中進行操作。建議配制完畢后瞬時離心以使液體沉至管底。
3:pcr反應(yīng):
降落pcr法(touchdown pcr):94℃變性2分鐘;首循環(huán):94℃變性30秒,68℃退火30秒,72℃延伸45秒;從第二到八個循環(huán)開始,每循環(huán)退火溫度下降1℃,其余不變;從第九個循環(huán)開始,反應(yīng)條件固定為:94℃變性30秒,60℃退火30秒,72℃延伸45秒,循環(huán)32次;循環(huán)結(jié)束后,在72℃延伸7分鐘,后保持在4℃。
4:瓊脂糖凝膠電泳:
按常規(guī)方法準(zhǔn)備好2%瓊脂糖凝膠,加入eb或gold-view等用于顯色。每份反應(yīng)液取8微升,無須加入上樣緩沖液,直接加入凝膠加樣孔中,另留一孔加入dna marker(要求在400-700bp區(qū)間有顯示條帶),120伏電泳約30分鐘。在紫外線下觀察電泳結(jié)果,陽性對照應(yīng)在643bp處有一條帶,陰性對照無條帶,檢測條帶在438-470bp區(qū)間。
pcr檢測試劑盒注意事項
1:組份a中含有染料,染料的加入不影響pcr反應(yīng),反應(yīng)產(chǎn)物可直接電泳,節(jié)省時間。
2:本試劑盒檢測范圍涵蓋支原體所有種屬,真核細(xì)胞和革蘭氏陰性菌不會造成干擾,與支原體親緣關(guān)系較近的革蘭氏陽性菌在反應(yīng)中的靈敏度較支原體低1000-10000倍。
3:本試劑盒適用于檢測支原體感染,客戶如需區(qū)分感染的種屬,可將pcr產(chǎn)物切膠然后測序,進行序列比對即可知種屬類型。
4:有時可直接用細(xì)胞培養(yǎng)上清進行pcr反應(yīng)。培養(yǎng)上清中常含有高濃度的pcr抑制劑,可能導(dǎo)致假陰性結(jié)果,故不建議使用此法。有些pcr抑制劑用離心可以除去,若離心不能去除,則推薦抽提基因組dna進行pcr。而某些pcr抑制劑,如黑色素,通過抽提基因組dna也不能去除,此時可以通過加入高濃度(如2%)的bsa(牛血清白蛋白)中和其抑制活性。
5:假陰性結(jié)果判斷方法:在測試反應(yīng)管中同時加入測試樣品和陽性對照樣品,觀察對照條帶是否出現(xiàn)。在陽性對照管出現(xiàn)對照條帶的情況下,如果測試反應(yīng)管的對照條帶和檢測條帶都沒有出現(xiàn),則可判斷為pcr反應(yīng)受到了抑制,即假陰性結(jié)果。陽性對照管如果沒有出現(xiàn)對照條帶,請檢查pcr條件是否恰當(dāng),或者與技術(shù)支持聯(lián)系。
6:每個測試樣品建議做兩個反應(yīng):一個與陽性對照樣品共同反應(yīng),排除假陰性結(jié)果,另一個單獨反應(yīng),可避免因加入陽性對照樣品所致的靈敏度降低。如果測試樣品中支原體含量很高,可能會抑制陽性對照條帶的出現(xiàn)。