微型水泵的簡單工作原理如下：
電機(jī)的圓周運(yùn)動(dòng)，通過機(jī)械裝置使水泵內(nèi)部的隔膜做往復(fù)式運(yùn)動(dòng)，從而壓縮、拉伸泵腔（固定容積）內(nèi)的空氣，在單向閥作用下，在排水口處形成正壓（實(shí)際輸出壓力大小跟泵排水口受到的助力和泵的特性有關(guān)）；在抽水口處形成真空，從而與外界大氣壓間產(chǎn)生壓力差。在壓力差的作用下，將水壓入進(jìn)水口，再從排水口排出。在電機(jī)傳遞的動(dòng)能作用下，水持續(xù)不斷的吸入、排出，形成較穩(wěn)定的流量。
主要用于水處理、環(huán)保、醫(yī)療、工業(yè)控制、科研實(shí)驗(yàn)室等對體積、噪音、功耗有較高要求，如提升、轉(zhuǎn)移、增壓、噴霧、噴灑、水循環(huán)、輸送等用途。
與大型抽水泵（如部分葉輪式、離心式等）每次使用前必須加水引導(dǎo)不同，微型抽水機(jī)有一個(gè)重要的功能：“自吸”，是指在每次抽水前，在不另外加引水的情況下，抽水機(jī)就能自動(dòng)將水吸上來。這一功能很方便，越來越來受到使用者的歡迎，尤其是高自吸吸程的微型水泵。
比如一款微型水泵bsp27250s，它的自吸高度就達(dá)到了5米，在微型抽水泵功率受限于體積的情況下，已經(jīng)算很高的了。