把硫酸鋅鋅肥和磷肥混合在一起施用，會形成不易溶解于水的磷酸鋅。農作物的根系對這種鋅很難吸收利用。因此施用硫酸鋅時，一定要避免與過磷酸鈣、重過磷酸鈣、磷酸二銨和磷酸二氫鉀等磷肥接觸，更不能混合在一起施用。用硫酸鋅作底肥施用，可以把硫酸鋅與農家肥均勻地摻在一起施入，到播種時再施磷肥。也可以把磷肥均勻地摻在農家肥中作底肥施入，播種時再施硫酸鋅。這樣能在鋅肥和磷肥之間形成隔離層，防止它們相互接觸。
播種玉米時用硫酸鋅作拌種肥，最好把磷肥摻在農家肥中作底肥施入，防止鋅肥與磷肥接觸。玉米苗期用硫酸鋅水溶液噴霧防治“花白苗”時，不能與磷酸二氫鉀或過磷酸鈣浸出液混合施用。
水稻施用硫酸鋅，無論是基施、噴施，還是大田拌細土撒施，施肥時同樣要避免與磷肥接觸。