兼氧處理法:兼氧處理是將厭氧處理廢水的過程控制在水解或酸化階段，利用兼性厭氧的水解產(chǎn)酸細菌，把廢水中難降解的復雜有機物轉化為簡單有機物的廢水處理方法。利用這種廢水處理方法不僅能降低水的污染程度，而且能降低其中有機物的復雜程度
而有利于好氧處理。例如，根據(jù)產(chǎn)甲烷細菌只有在中性和厭氧條件下緩慢生長的特點，通過改變環(huán)境的ph值、通氧量、溫度等因素，抑制產(chǎn)甲烷細菌的生長，從而使有機污染物的分解處于水解階段。兼氧處理適用于pva廢水、表面活性劑廢水、焦化廢水、印染廢水的處理。
光合細菌法:光合細菌(photosynthetic bacteria，psb)能在厭氧光照條件下進行不產(chǎn)氧的光合作用，具有隨生長條件的變化而靈活改變代謝類型的特點，因此它能處理每升上萬毫克bod濃度的有機廢水。同時psb細胞內(nèi)富含占細胞總量約65％的蛋白質和維生索b，具有巨大的實用價值，可作為禽畜飼料和魚蝦餌料等。目前用于有機廢水處理的psb主要是紅螺菌科的類群，它們不僅能在厭氧光照下以低級脂肪酸、多種二羧酸、醇類、糖類、芳香族化合物等低分子有機物作為光合作用的電子供體，進行光能異養(yǎng)生長；而且能在好氧黑暗條件下，以有機物為呼吸基質進行好氧異養(yǎng)生長。因此，psb既不像好氧的活性污泥細菌那樣受污水中溶解氧濃度的限制，它可以利用光能進行高效的能量代謝，即使是微弱的光照也能利用；又不像嚴格厭氧的產(chǎn)甲烷細菌等對氧的存在非常敏感，恰恰相反，它可以在有氧條件下分解有機物，通過氧化磷酸化獲得能量。斟此，在psb處理系統(tǒng)中．保持自然光和微好氧條件，就有可能維持psb在系統(tǒng)中的優(yōu)勢，充分發(fā)揮它的處理能力。
光合細菌在有光照缺氧的環(huán)境中能進行光合作用，利用光能進行光合作用，利用光能同化二氧化碳，與綠色植物不同的是,它們的光合作用是不產(chǎn)氧的。光合細菌細胞內(nèi)只有一個光系統(tǒng)，即psi，光合作用的原始供氫體不是水，而是h2s （或一些有機物），這樣它進行光合作用的結果是產(chǎn)生了h2，分解有機物，同時還能固定空氣的分子氮生氨。光合細菌在自身的同化代謝過程中，又完成了產(chǎn)氫、固氮、分解有機物三個自然界物質循環(huán)中極為重要的化學過程。這些*的生理特性使它們在生態(tài)系統(tǒng)中的地位顯得極為重要。
光合細菌的適宜水溫為15—400c,適水溫為28—360c。在水產(chǎn)養(yǎng)殖中，能夠降解水體中的亞硝酸鹽、硫化物等有毒物質，實現(xiàn)充當餌料、凈化水質、預防疾病、作為飼料添加劑等功能，光合細菌適應性強，能忍耐高深度的有機廢水和較強的分解轉化能力，對酚、氰等毒物有一定有忍受和分解能力等特點，它的諸多特性，使其在無公害水產(chǎn)養(yǎng)殖中具有巨大的應用價值。