目標(biāo)區(qū)域捕獲測(cè)序技術(shù)，是根據(jù)已知特定基因組區(qū)域序列設(shè)計(jì)寡核苷酸探針，通過雜交將目標(biāo)區(qū)域捕獲富集進(jìn)行二代測(cè)序。其針對(duì)目標(biāo)區(qū)域深度測(cè)序，增加了檢查靈敏度和準(zhǔn)確性。既滿足研究需求，又降低測(cè)序成本，在科研、臨床中均備受關(guān)注。
液體處理專家貝克曼庫(kù)爾特推出biomek 自動(dòng)化捕獲測(cè)序方案，幫助您實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化、標(biāo)準(zhǔn)化的捕獲測(cè)序。 由自動(dòng)化工作站進(jìn)行基因捕獲，可以減少手工操作時(shí)間，提高工作效率，增加結(jié)果的重復(fù)性和均一性。 biomek工作站可實(shí)現(xiàn)從核酸提取，文庫(kù)構(gòu)建，定量混樣到捕獲的整體實(shí)驗(yàn)流程。
figure 1. 捕獲測(cè)序文庫(kù)構(gòu)建自動(dòng)化流程
由biomek成功自動(dòng)化的雜交捕獲試劑盒：
agilent haloplex™ target enrichment - ion torrent
agilent sureselect xt®
epicentre scriptseq® complete gold low input
illumina nextera® rapid capture
illumina truseq® exome
illumina truseq® rapid exome
illumina trusight® cancer
illumina trusight® tumor 15
illumina trusight® tumor 170
idt xgen® exome research panel
neb nebnext direct™ cancer hotspot panel
roche nimblegen seqcap ez® for illumina ngs
biomek自動(dòng)化捕獲測(cè)序數(shù)據(jù)展示
figure 2. idt xgen®exome research panel試劑盒捕獲測(cè)序文庫(kù)制備。
上圖： 片段分析，其中主峰1和2為雜交捕獲后cfdna目標(biāo)片段峰；
下圖：qubit fluorometric quantification核酸定量結(jié)果。
figure 3. idt xgen®雜交捕獲試劑盒歷史手工數(shù)據(jù)vs.
biomek i7自動(dòng)化工作站完成數(shù)據(jù)。a.平均中靶率，b. 重復(fù)率，c. 覆蓋度，d. gc偏移。
biomek向?qū)杰浖僮鹘缑?br>在軟件操作界面上用戶可以選擇樣本數(shù)量，是否使用臺(tái)面整合的pcr儀，以及運(yùn)行工作流程的哪個(gè)部分。此外，具備臺(tái)面自動(dòng)校對(duì)功能，當(dāng)操作人員完成耗材擺放后，工作站可根據(jù)攝像頭拍攝，自動(dòng)判定耗材擺放是否正確，對(duì)錯(cuò)誤擺放位置進(jìn)行提示。避免由于人為擺放耗材錯(cuò)誤，導(dǎo)致設(shè)備碰撞或試劑、時(shí)間損失。
figure 4. 向?qū)杰浖僮鳎琲dt xgen®雜交捕獲試劑盒方法選擇界面。
biomek自動(dòng)化捕獲測(cè)序——實(shí)踐速度與通量的飛躍
figure 5. 完成 24/48/96個(gè)樣本的自動(dòng)化idt xgen®雜交捕獲測(cè)序文庫(kù)制備預(yù)估耗時(shí)。