基因測序技術(shù)是一種基因檢測技術(shù),也被稱為dna測序技術(shù),是進行分子生物學(xué)研究和基因改造的基礎(chǔ),也是解鎖人類生命奧秘的重要方式之一。基因測序技術(shù)發(fā)展了40余年,已在眾多領(lǐng)域被廣泛應(yīng)用,包括生物的基因組圖譜繪制、物種進化演替過程、表觀遺傳學(xué)、疾病相關(guān)基因的確定和診斷等等。近年來,基因測序相關(guān)產(chǎn)品和技術(shù)由實驗室研究演變到臨床使用,為我們理解人類生物學(xué)特征和疾病,評估遺傳疾病提供了關(guān)鍵性信息,所以說基因測序技術(shù)是下一個改變世界的技術(shù)毫不為過。
在疫情期間,這項技術(shù)得到了更多人的關(guān)注。疫情爆發(fā)初期,在不到一個月的時間內(nèi),通過基因測序技術(shù),病毒的基因組序列被公布,為分析病毒的進化來源、致病機制提供了一手資料。不少也發(fā)起了患者基因測序計劃,以了解個人基因?qū)Σ《靖腥痉磻?yīng)的影響,這項研究的數(shù)據(jù)將為患者護理及藥物處方提供信息,未來還可以幫助疫苗設(shè)計,從而拯救更多生命。
整個測序環(huán)節(jié)中,從樣品收集到上機測序,水貫穿了包括測序儀的日常清洗維護和試劑配制在內(nèi)的每一個環(huán)節(jié)。作為一個*的基礎(chǔ)試劑,水的品質(zhì)對終測序結(jié)果會產(chǎn)生顯著影響。水中的雜質(zhì),如無機鹽、有機物、核酸酶、顆粒物等,不僅會污染設(shè)備,縮短測序儀毛細管的使用壽命,而且還會降低dna聚合酶的活性,終干擾測序結(jié)果的準確性。
下面這些基因測序經(jīng)常遇到的問題很有可能是使用的水有問題,快來看看你有沒有中招…
q1:dna測序樣品用什么溶劑溶解比較好?
溶解dna測序樣品,使用超純水溶解較好。
原因:dna的測序反應(yīng)的原理其實就是taq酶的聚合反應(yīng),需要一個適合的酶反應(yīng)條件。如果溶解dna樣品的溶液含有過多的鹽,會影響測序反應(yīng)體系,造成taq酶的聚合性能下降,干擾測序反應(yīng)甚至無法產(chǎn)生信號。
純水應(yīng)用tips:超純水機采用基因測序超純化柱,rephile 配方填料的低鎂型純化柱,可以特異性去除水中的鎂離子,降低空白本底對測序反應(yīng)體系的影響。
q2:測序結(jié)果怎么沒有峰圖呢?
原因:模板被降解,罪魁禍首可能是測序使用的水中含有核酸酶。
純水應(yīng)用tips:制備超純水的超純水機需要帶有終端濾器,如樂楓生物的rephibio終端濾器,可以去除dna酶和rna酶。
q3:為什么測序峰圖出現(xiàn)了“瀑布效應(yīng)”?
“瀑布效應(yīng)”是基線突然從高處下降的現(xiàn)象。
原因:樣品被有機物污染,有機物會被激發(fā)產(chǎn)生熒光,抬高基線。
純水應(yīng)用tips:使用帶有toc檢測系統(tǒng)的超純水機,如樂楓genie系列智能超純水系統(tǒng),有機物含量低于5 ppb,采用全氧化法設(shè)計的toc在線監(jiān)測系統(tǒng),在線監(jiān)測toc含量,符合ispe制藥工程指南 / 美國藥典usp等標準對于toc檢測的要求。
q4:“釘子峰”如何避免?
“釘子峰”是a、t、c、g四個顏色的峰都被突然拔起,形成的尖銳峰形。
原因:溶液中可能存在氣泡或者顆粒,氣泡和顆粒對激光全反射,形成“釘子峰”。
純水應(yīng)用tips:純水機取水口配備0.22μm的終端濾器,測序之前使用超聲波對超純水進行脫氣可以有效地防止“釘子峰”。
樂楓生物genie系列智能純水系統(tǒng)以穩(wěn)定的水質(zhì)、智能的操作系統(tǒng)充分滿足基因測序用水需求,在諸多應(yīng)用到測序儀的實驗室常常會看到樂楓生物genie系列智能超純水系統(tǒng)的身影。華大基因海外“火眼實驗室”采用的超純水機是genie 系列的超純水系統(tǒng)。
關(guān)于樂楓生物
樂楓生物(rephile bioscience,ltd.) 是一家專業(yè)從事水純化和實驗室分離純化產(chǎn)品研發(fā)、設(shè)計和制造的企業(yè),為高科技生物技術(shù)和生命科學(xué)領(lǐng)域的用戶服務(wù)。樂楓公司著眼于發(fā)展,在中國、美國、法國、印度、南非等近20個建立了銷售機構(gòu),同時也為大型公司提供oem和odm,產(chǎn)品銷往包括歐美的近100個。成立十余年,樂楓持續(xù)投入研發(fā),創(chuàng)立出了自己的產(chǎn)品品牌rephile(瑞楓),推出了多個新概念產(chǎn)品- 無線連接的genie系列純水系統(tǒng)和智能型大流量純水工作站super-genie等。目前樂楓純化柱填料配方齊全,也提供多款密理博純水系統(tǒng)的兼容耗材。
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